1999. godine – Ministarstvo prosvete i Kulturno prosvetna zajednica Srbije dodelilo je MŠ „Isidor Bajić“ Vukovu nagradu.
2004. godine u Madridu – International New Milenium Aword for the Best Trade Name – školi i direktoru škole za uspešnost u radu i rukovođenju u oblasti muzičkog obrazovanja i kulture.
2006. godine – Muzičkoj školi „Isidor Bajić“, kao najeminentnijoj vaspitno – obrazovnoj i kulturnoj instituciji u Jugoistočnoj evropi, ukazana je čast i poverenje da postane deo prestižne Asocijacije Udruženja kraljevskih muzičkih škola (ABRSM). Udruženje kraljevskih muzičkih škola je vodeća svetska organizacija iz oblasti muzičkih obrazovanja. Udruženje je privilegovano zastupanjem četiri Kraljevske muzičke akademije: Royal Academy of Music (London), Royal College of Music (London), Royal Northern College of Music (Mančester) i Royal Scottish Academy of Music and Drama (Glasgov). Učenicima MŠ „Isidor Bajić“ pruža se ekskluzivno pravo upisa u sistem Kraljevskih muzičkih škola (ABRSM).
2007. godine – Odbor za dodelu Priznanja je doneo odluku da zbog izuzetnih rezultata u obrazovno – vaspitnom radu, postignutih zahvaljujući posvećenosti, pedagoškom radu sa učenicima, istrajnosti u kvalitetnim projektima, ostvarenog jedinstva talenta, inovacija i vrednog i predanog rada, kao i zbog afirmacije muzičkog i kulturnog stvaralaštva i izuzetnog međunarodnog predstavljanja rada, MŠ. „Isidor Bajić“ dodeli priznanje „Dr Đorđe Natošević“.